冷链系统是指冷冻冷藏产品或易腐食品在生产、保存、运输配送、流通加工、销售直至消费终端的过程中，始终保持恒温或低温，防止物品品质变异的活动，这一活动的每个环节有机的结合起来就组成了一个无缝连接的供应链系统，由于它是一个处于冷链状态下的系统，所以我们称之为冷链系统。
据介绍，疾控中心为疫苗的发放建立起了“冷链”机制，疫苗运输车将疫苗运往各个接种点，随后疫苗会很快被转移到医用冰箱中储存，并对疫苗进行记录，每一支疫苗的去向，都会被严密“”。“只要疫苗是从国家正规途径进来的，是冷链运输，中间的存储、接种技术不发生问题，是很少会出现不良反应的。”
由于食品冷链是以易腐食品品质为目的，以保持低温为核心要求的供应链系统，所以它比一般常温物流系统的要求更高，更复杂，建设投资也要大很多，是一个庞大的系统工程。其次，易腐食品的时效性要求冷链各环节具有更高的组织协调性。第三，食品冷链的运作始终是和能耗成本相关联，有效控制运作成本与食品冷链的发展密切相关。
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